高性價比

    在結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域清華大學(xué)走在了科技的最前沿。清華生命學(xué)院決定采用戴爾高性能計算群集方案（HPCC-High Performance Computing Cluster）為結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究提供一個更為高效的研究平臺，創(chuàng)造更為良好的研究環(huán)境。

    2010年初，清華生命學(xué)院經(jīng)過廣泛考察、慎重選型、反復(fù)測算最終決定引進1套大規(guī)模的44計算節(jié)點的戴爾HPCC系統(tǒng)，該系統(tǒng)由”計算節(jié)點“、”管理節(jié)點I/O節(jié)點“、”存儲后臺“”計算與管理網(wǎng)絡(luò)“4個主要部分構(gòu)成：其中HPCC系統(tǒng)的計算節(jié)點由11臺戴爾PowerEdgeTM C6100機架式服務(wù)器擔(dān)任，每臺C6100機箱內(nèi)配置有4臺刀片服務(wù)器，每臺刀片配置了兩顆2.4GHz英特爾R至強R5645 六核處理器、24GB內(nèi)存（6x4GB）、1塊3.5英寸7.2K RPM SATAII硬盤，2塊Broadcom 10/100/1000Mbps 自適應(yīng)以太網(wǎng)卡（支持TOE offload 引擎技術(shù)）

    ”戴爾C6100服務(wù)器+Infiniband網(wǎng)絡(luò)“為核心的HPCC系統(tǒng)于2010年3月完成組裝和調(diào)試，目前已運行了1年多的時間，整體運行狀況非常平穩(wěn)。清華大學(xué)生命學(xué)院崔野老師是這套HPCC系統(tǒng)的主要管理者，他對系統(tǒng)的表現(xiàn)給予了充分的肯定。崔野老師介紹說：”目前，生命學(xué)院結(jié)構(gòu)生物研究的主要計算任務(wù)均由這套HPCC系統(tǒng)來完成。該系統(tǒng)的上線，有效地保障了我們在大分子研究方面的計算效率，與傳統(tǒng)的機架式服務(wù)器組成的HPCC相比，采用戴爾C6100服務(wù)器我們可以節(jié)省50%的空間，節(jié)省30%以上的電力消耗，這可以讓我們的運營成本得到有效的控制。“

    崔野老師接著介紹說："從實際效果看，戴爾HPCC運行穩(wěn)定，數(shù)據(jù)處理速度很快，完全能夠滿足我們開展大規(guī)模科學(xué)計算的要求。我們當(dāng)前工作的重點是利用HPCC系統(tǒng)進行大分子蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的研究計算，這種研究時效性強，緊迫性高，任務(wù)繁重，要求HPCC系統(tǒng)必須具有超強的計算能力，而戴爾HPCC的浮點運算速度峰值可以達到每秒五萬億次（5TFLOPS），我們對這樣的計算能力感到十分滿意。此外從發(fā)展的角度來看，戴爾HPCC系統(tǒng)的高效性為日后結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究工作的深入打下了非常扎實的基礎(chǔ)。"